【解析】

根据金属、大多数固态非金属单质等由原子构成，有些物质是由分子构成的，如水、氢气等，有些物质是由离子构成的，如氯化钠，进行分析判断即可。

【详解】

A、水是由水分子构成的，故选项正确。
B、金刚石属于固态非金属单质，是由碳原子直接构成的，故选项错误。
C、硅属于固态非金属单质，是由硅原子直接构成的，故选项错误。
D、氢氧化钠是由钠离子和氢氧根离子构成的，故选项错误。
故选：A。