【解析】

【分析】观察是科学探究的一种基本方法。科学观察可以直接用肉眼，也可以借助放大镜、显微镜等仪器，或利用照相机、录像机、摄像机等工具，有时还需要测量。

【详解】A、观察肾蕨需用放大镜观察孢子囊群和孢子，A正确。
B、胚珠在子房的中间部位，一般用解剖刀或刀片纵向剖开子房即可观察到胚珠的结构，胚珠不是细微结构（胚珠较大），用放大镜观察便可，B错误。
C、把叶片放入盛有酒精的小烧杯中目的是用酒精溶解叶片中的叶绿素，便于观察。装有酒精和叶片的小烧杯，一定要隔水加热。这是因为酒精的沸点比水低，如果直接放在火上加热，不仅酒精蒸发太快，造成浪费，而且溶解叶绿素的效果也不够好，尤其容易引燃酒精发生危险。使用水对酒精进行加热，起到控温作用，以免酒精燃烧发生危险，C正确。
D、植物的蒸腾作用是每时每刻都在进行的，只是白天的蒸腾作用比晚上要强一些，所以气孔是白天、晚上都张开的，只是张开的大小程度不同而已。只有当中午光线很强，气温很高时，气孔会关闭，防止水分过度散失。因此萎蔫叶片上气孔数量和新鲜叶片一样多，只是萎蔫叶片上的气孔是闭合的，防止水分进一步蒸发，制作新鲜叶片表皮和萎蔫叶片表皮的临时装片目的是对照、验证，D正确。
故选：B

【点睛】在观察中要注意从多方面、多层次、多角度来审视观察对象，不能以局部代替整体，不能以主观代替客观事实，还要注意抓住事物的本质特征，不能被表面现象所迷惑。